3.2 no modo de processamento em lote

Para rodar um script no modo de processamento em lote do através do seguinte comando no terminal Linux:

$ R CMD BATCH opcoes arqentrada arqsaida

Onde: arqentradaé o nome do script (arquivo com a extensão .R) a ser executado; arqsaida é o arquivo (com a extensão .Rout) com as saídas dos comandos executados no R; opcoes é a lista de opções que controlam a execução.

Vamos rodar como exemplo, o script1.R da seção 3.1.5.

$ R CMD BATCH /home/usuario/adar/script1.R

O comando acima, produzirá dois arquivos de saída:

  1. script1.Rout15 criado por default quando o arqsaida não é especificado, e;
  1. arquivo "plot-script1.pdf".

Você pode especificar o nome do arqsaida como desejar. No exemplo abaixo, mostra-se como salvar o arquivo de saída incluindo a data em que ele foi gerado, script1-saida-adatadehoje.log.

$ R CMD BATCH script1.R script1-saida-`date "+%Y%m%d"`.log

Após a execução do último comando, os mesmos arquivos resultantes do comando anterior serão gerados, exceto pelo primeiro (.Rout), que será nomeado script1-saida-20200518.Rout.

Para mais opções do comando R CMD BATCH digite no terminal do Linux R --help.

  1. Você pode notar que este arquivo tem o mesmo nome do arqentrada, exceto que a sua extensão foi alterada para .Rout.↩