2.1 Instalação do R e RStudio

A interação do usuário com o é por meio da linha de comando. A interface da linha de comando tem suas vantagens, mas você será mais produtivo com o uso de uma Interface de Desenvolvimento Integrado (IDE) como o RStudio Desktop.

A seguir veremos como:

  • instalar o nos SO Windows e Linux Ubuntu

  • manter o sempre atualizado no Linux Ubuntu

  • configurar um diretório para armazenar os pacotes do R instalados

  • instalar pacotes

  • instalar o RStudio Desktop

Neste livro, o maior foco na instalação do é dada para o SO Linux Ubuntu, pelo fato de assim como o R, ser um software livre e de código aberto. Como o Linux Ubuntu é baseado no Debian o procedimento de instalação também se estende a essa distribuição Linux e as versões derivadas do Ubuntu oficialmente reconhecidas.

A instalação no SO Windows é igual a instalação de qualquer outro software e pode ser facilmente encontrada na internet. Por esta razão, somente indicou-se o caminho de instalação.

2.1.1 Instalando o R

O pode ser instalado a partir dos binários pré-compilados ou do código fonte. Nós veremos a instalação do a partir dos arquivos binários.

2.1.1.1 Windows

O binário executável do para o Windows está disponível na Rede Abrangente de Arquivos do (CRAN) e pode ser baixado aqui.

Abra o executável e siga instruções de instalação mantendo todas as opções padrões.

No Windows a instalação do inclui uma Interface Gráfica do Usuário (GUI) acessível pelo executável RGui.exe (Figura 2.1). Um atalho para esse executável é gerado por default na área de trabalho com o símbolo do .

Interface gráfica do usuário no R para Windows.

Figura 2.1: Interface gráfica do usuário no R para Windows.

Para instalar pacotes de plataformas diferentes da CRAN (veja seção 2.2.1.2) é necessário instalar o programa Rtools, selecionando a versão adequada para sua versão do .

2.1.1.1.1 Atualização do R no Windows

Novas versões do R são disponibilizadas em geral com frequência de 5 vezes por ano. Recomenda-se manter o R atualizado, pois as novas versões incluem aperfeiçoamentos e a correção de bugs.

As novas versões do vem com os pacotes padrões do R. Os demais pacotes instalados pelo usuário na versão anterior precisam ser reinstalados.

Para atualizar o no Windows, ao invés de baixar o executável a cada nova versão e repetir o processo da seção anterior, você pode utilizar o pacote installr, usando o código abaixo e seguindo as instruções da interface.

#install.packages("installr")
library("installr")
installr()

Em seguida, atualize os atalhos do de sua área trabalho ou da barra de tarefas para o caminho da versão do R. Ao abrir a nova versão verifique a versão instalada com:

# nova versão instalada
R.Version()$version.string
## [1] "R version 4.0.2 (2020-06-22)"

O próximo passo é atualizar os pacotes para a nova versão que será visto na seção 2.2.2.

2.1.1.2 Linux

2.1.1.2.1 Ubuntu

Há várias formas de instalar o no Ubuntu. Mas primeiro, caso você tenha alguma versão antiga do R, desinstale-a com:

$ sudo apt-get remove r-base-core

A forma mais fácil de instalar o é usar a versão compilada no repositório default do Ubuntu.

$ sudo apt-get install r-base

Entretanto, como o R é um projeto de evolução rápida, a versão estável mais recente4 não está disponível nos repositórios do Ubuntu. Dessa forma, não conseguimos usufruir dos pacotes mais recentes (ou em desenvolvimento), que geralmente incluem o estado da arte da ciência de dados. Por esta razão, vamos instalar a última versão do e de forma que seja atualizado automaticamente pelo sistema. Isto pode ser feito com os comandos a seguir.

  1. Incluímos o endereço do repositório externo mantido pelo CRAN5 à lista de repositórios do sistema.6
$ sudo touch /etc/apt/sources.list.d/cran.list
$ sudo sh -c "echo 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu `lsb_release -sc`-cran40/' >> /etc/apt/sources.list.d/cran.list"
  1. Adicionamos a chave de autenticação7 do repositório.
$ sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
  1. Atualizamos a lista de repositórios do sistema.
sudo apt-get update
  1. Instalamos o R
$ sudo apt-get install -y r-base r-base-dev

Para iniciar o no Linux, digite R no cursor do terminal:

$ R

A partir desse momento já começamos uma sessão no . Vamos simplesmente plotar uma sequência numérica.

> plot(1:10)

Após este teste, podemos sair do , sem salvar os dados da seção, com a expressão abaixo:

> q(save = "no")

2.1.1.3 Diretório para pacotes instalados pelo usuário

Os pacotes que vem com os pacotes r-base e r-recommended são instalados no diretório /usr/lib/R/library. Estes pacotes são atualizados pelo sistema8 ou usando sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade.

Uma boa prática para os pacotes R instalados pelo usuário é definir um diretório específico. Isso lhe dá mais controle sobre os pacotes do instalados no sistema. Um local sugerido é o /home/usuario/.R/libs. O seu home ou pasta pessoal pode ser obtido com o comando echo $HOME. Para criar o diretório você pode digitar o comando abaixo:

$ mkdir -p `echo $HOME`/.R/libs/

Para informar ao onde procurar os pacotes instalados, você precisa criar um arquivo chamado .Renviron, no diretório $HOME, contendo a expressão R_LIBS=/home/usuario/.R/libs/. Você pode fazer isso em um terminal com os comandos:

$ R_LIBS=`echo $HOME/.R/libs/`
$ echo $R_LIBS >> `echo $HOME/.Renviron`

Esse caminho fica então visível ao , o que pode ser verificado executando a função .libPaths() na linha de comando do .

Abra o :

$ R

e ao digitar:

> .libPaths()
[1] "/home/travis/R/Library"        "/usr/local/lib/R/site-library"
[3] "/opt/R/4.0.2/lib/R/library"

o seu diretório /home/usuario/.R/libs9 deve aparecer em primeiro lugar. Indicando que este local tem prioridade para instalação dos pacotes. Caso o diretório deixe de existir os diretórios seguintes serão usados.

  1. A versão mais atual no período de elaboração deste texto foi a R 4.0.3.↩

  2. Usando https://cloud.r-project.org automaticamente redireciona para o espelho da CRAN mais próximo. A lista de espelhos atual encontra-se em https://cran.r-project.org/mirrors.html.↩

  3. A execução destes comandos requer privilégios de superusuário. Caso não tenha, consulte o administrador do sistema.↩

  4. Chave pública de autenticação é um meio alternativo de se logar em um servidor ao invés de digitar uma senha. É uma forma mais segura e flexível, mas mais difícil de ser configurada. Esse meio alternativo de fazer login é importante se o computador está visível na internet. Para saber mais veja aqui.↩

  5. Por ser atualizado automaticamente pelo sistema, às vezes o usuário nem percebe que a versão do R mudou.↩

  6. Diretórios precedidos por "." no Linux são diretórios ocultos. O diretório /home/usuario/.R é um diretório oculto, para visualizá-lo no Ubuntu, na interface gráfica do sistema, acesse View > Show Hidden Files (ou Visualizar > Mostrar arquivos ocultos). No terminal utilize ls -a para listar os arquivos ocultos.↩